中國地質(zhì)調(diào)查局1999年開展的《全國地下水與環(huán)境綜合評價》（即“新一輪全國地下水資源評價”）項目，重新評價了全國32個省（區(qū)、市）和香港、澳門兩個行政區(qū)，2000多個縣（市）的地下水天然資源、可開采資源，系統(tǒng)評價了全國地下水環(huán)境質(zhì)量，編制了我國第一部地下水資源與環(huán)境圖集，全面更新了地下水資源數(shù)據(jù)，為國家水資源綜合規(guī)劃的編制、水資源宏觀管理、防治地下水污染、可持續(xù)利用地下水環(huán)境保護提供了科學(xué)依據(jù)。
新一輪全國地下水資源評價的最新結(jié)果是：我國地下水天然資源量多年平均為9235億立方米。其中，地下淡水天然資源多年平均為8837億立方米，約占全國水資源總量的1/3。其中，山區(qū)為6561億立方米，平原為2276億立方米；地下微咸水天然資源多年平均為277億立方米，半咸水天然資源多年平均為121億立方米。全國地下淡水可開采資源量多年平均為3527億立方米。其中，山區(qū)為1966億立方米，平原為1561億立方米。深層承壓水年可開采儲存量約為110億立方米／年。
這一項目還查明了從1984年以來地下水資源所發(fā)生的變化及其原因。調(diào)查表明，1999年全國地下水開采量達1116億立方米，全國平均開采程度為29.9%，其中河北省、天津市、北京市全境超采。近20年來，地下水所占總供水量的比例一直呈增長趨勢，已從1980年的14%增長到 1999年的 18.7%,農(nóng)業(yè)用水量呈遞減趨勢，工業(yè)和生活用水量卻明顯上升。目前，全國擁有地下水開采井500萬眼，有310多個城市以開采地下水作為城市供水水源，約占全國城市的71%，54座城市以開采地下水為主要水源地，全國70%的人口飲用地下水，北方城市生活和工業(yè)用水中地下水占90%左右。
新一輪全國地下水資源評價首次對全國地下水環(huán)境質(zhì)量進行了綜合評價，從地下水水質(zhì)、地下水污染程度、地下水不合理開發(fā)誘發(fā)的環(huán)境地質(zhì)問題及地下水脆弱性等方面較全面地論述了我國地下水環(huán)境質(zhì)量。評價結(jié)果表明，在全國地下水資源中，95％的地下水可用做生活飲用水水源及工農(nóng)業(yè)供水。其中，80%的地下水可供直接飲用，10%的地下水為適當(dāng)處理后可供飲用，5%為不宜飲用但可直接為農(nóng)業(yè)和部分工業(yè)利用；另有不足5％的地下水資源因遭受污染等影響，需經(jīng)深度處理才可利用。南方地區(qū)地下水質(zhì)量優(yōu)良，大多地下水可供直接飲用。北方山區(qū)及山前平原地區(qū)水質(zhì)較好，中部平原區(qū)較差，濱海地區(qū)水質(zhì)最差。全國31個省（區(qū)、市）不同程度地存在著與飲用水水質(zhì)有關(guān)的地方病區(qū)。據(jù)不完全統(tǒng)計，全國有5000多萬人仍在飲用不符合飲用水標準的地下水。
調(diào)查表明，由于超采地下水，全國已形成區(qū)域地下水降落漏斗100多處，面積大于5萬平方公里。河北平原深層地下水已經(jīng)形成了跨冀、京、津、魯?shù)沫h(huán)渤海區(qū)域地下水降落漏斗。全國有50個城市由于不合理開采地下水而發(fā)生了地面沉降；許多地方出現(xiàn)了地裂縫，沿海城市和地區(qū)地下水位下降，引起海水入侵，導(dǎo)致地下水水質(zhì)惡化。
新一輪全國地下水資源評價還編制了我國第一部地下水資源與環(huán)境圖集，圖集包括序圖組、全國圖組、地區(qū)圖組和分省圖組共計126幅圖，這些圖組包括地下水資源分布圖、地下水資源開發(fā)利用狀況圖、地下水環(huán)境圖，而且成圖比例尺跨度大，從1：50萬至1：2400萬，共計23種比例尺。同時，建立了以空間數(shù)據(jù)庫為主體的中國地下水資源綜合評價與決策管理信息系統(tǒng)——信息化“數(shù)字地下水”平臺，形成了以空間信息系統(tǒng)為平臺的地下水資源評價科技支撐體系。
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